吴嘉甫说，从目前情况看，水书文化研究大多停留在外围层面，难以深入水书内部进行探索。进入水书文化内部进行研究，是水书文化研究的本质，是水书文化研究的核心与根本。这方面的研究成果很少，有关这方面的国家课题也没有申报与立项，这是水书文化研究的难点与重点，应组织力量设法攻坚突破。这是水书文化自身研究的需要，也是水书申报世界非物质文化遗产名录的重要基础资料。

    他说，水书文化的抢救保护，是为了传承研究以及开发利用，如果抓不好水书文化的深入研究，那么目前征集和出版的不少水书资料，包括最近出版的１６０册《中国水书》影印本等，就失去了重要意义。